Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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