Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms