Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms