Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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BC024978J3QPC3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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BC024978J3QPC3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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BC024978J3QPC3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
BC024978J3QPC3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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BC024978J3QPC3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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BC024978J3QPC3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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