Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc8E9PWG2 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms