Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms