Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms