Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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