Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms