Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Ubl3Q9Z2M6 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ubl3Q9Z2M6 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ubl3Q9Z2M6 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ubl3Q9Z2M6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ubl3Q9Z2M6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ubl3Q9Z2M6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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