Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop7Q9DCH2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms