Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf6Q9DBU5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf6Q9DBU5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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