Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms