Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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