Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snapc3Q9D2C9 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms