Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms