Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fcf1Q9CTH6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms