Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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