Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms