Protein–RNA interactions for Protein: Q99N85

Mrps18a, 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18aQ99N85 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrps18aQ99N85 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrps18aQ99N85 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms