Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg10Q8R1P4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms