Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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