Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp54Q8BL06 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp54Q8BL06 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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