Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms