Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms