Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms