Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp49Q6P9L4 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp49Q6P9L4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms