Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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