Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm5aQ3UXZ9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm5aQ3UXZ9 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm5aQ3UXZ9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm5aQ3UXZ9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kdm5aQ3UXZ9 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm5aQ3UXZ9 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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