Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms