Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms