Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms