Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Q3U6N9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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