Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms