Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms