Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms