Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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