Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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Ccl7Q03366 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Ccl7Q03366 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Ccl7Q03366 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ccl7Q03366 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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