Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Thbs2Q03350 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms