Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms