Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms