Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tcp10b-201ENSMUST00000086787 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Pcdhb12-201ENSMUST00000055495 3034 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Klhl20-201ENSMUST00000111611 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm37464-201ENSMUST00000192431 2220 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Styk1-201ENSMUST00000049150 3380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms