Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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