Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms