Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms