Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Polr2iP60898 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Polr2iP60898 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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