Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms