Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms