Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RorcP51450 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RorcP51450 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RorcP51450 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms