Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpdP50404 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpdP50404 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms